По первому образованию - радиотехник космического машиностроения, в процессе получения высшего экономического образования принял решение стать актером.
Затем окончил актерский факультет ВГИКа (мастерская Е.А.Киндинова).

Весь путь, включая переезд в столицу, заучивание наспех басни и само триумфальное поступление во ВГИК заняло ровно две недели.
Еще будучи студентом, Андрей полюбил сниматься у молодых неизвестных режиссеров.
Энтузиазм был вознагражден: за роль в короткометражном фильме «Как я провела лето» А. Мерзликин получил приз за лучшую мужскую роль на фестивале ВГИКа.
В 2000 году работал в международном проекте «Отель «Европа» (режиссер Иван Поповски), с ним объездил крупнейшие театральные фестивали Европы (Вена, Бонн, Авиньон, Стокгольм, Болонья).
Первая большая и при этом самая неоднозначная роль в кино - фильм «Бумер» Петра Буслова.

В настоящее время Андрей Мерзликин состоит в штате Московского Драматического Театра под руководством Армена Борисовича Джигарханяна.